Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW1

Prune1, Exopolyphosphatase PRUNE1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune1Q8BIW1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prune1Q8BIW1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms