Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbfox3Q8BIF2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbfox3Q8BIF2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbfox3Q8BIF2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbfox3Q8BIF2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbfox3Q8BIF2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbfox3Q8BIF2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbfox3Q8BIF2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbfox3Q8BIF2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbfox3Q8BIF2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbfox3Q8BIF2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbfox3Q8BIF2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbfox3Q8BIF2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbfox3Q8BIF2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbfox3Q8BIF2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbfox3Q8BIF2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbfox3Q8BIF2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbfox3Q8BIF2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbfox3Q8BIF2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbfox3Q8BIF2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbfox3Q8BIF2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbfox3Q8BIF2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbfox3Q8BIF2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbfox3Q8BIF2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbfox3Q8BIF2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbfox3Q8BIF2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbfox3Q8BIF2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbfox3Q8BIF2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbfox3Q8BIF2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbfox3Q8BIF2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbfox3Q8BIF2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms