Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms