Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Vipas39Q8BGQ1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vipas39Q8BGQ1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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