Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sv2bQ8BG39 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sv2bQ8BG39 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms