Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Jmjd4Q8BFT6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Jmjd4Q8BFT6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms