Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim19Q80ZU4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim19Q80ZU4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim19Q80ZU4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim19Q80ZU4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim19Q80ZU4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim19Q80ZU4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim19Q80ZU4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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