Protein–RNA interactions for Protein: Q80ST9

Lca5, Lebercilin, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lca5Q80ST9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lca5Q80ST9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms