Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna12Q80SS5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms