Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Shq1Q7TMX5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Shq1Q7TMX5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Shq1Q7TMX5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Shq1Q7TMX5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Shq1Q7TMX5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Shq1Q7TMX5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Shq1Q7TMX5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Shq1Q7TMX5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Shq1Q7TMX5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Shq1Q7TMX5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Shq1Q7TMX5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Shq1Q7TMX5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Shq1Q7TMX5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Shq1Q7TMX5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Shq1Q7TMX5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Shq1Q7TMX5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Shq1Q7TMX5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Shq1Q7TMX5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Shq1Q7TMX5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Shq1Q7TMX5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Shq1Q7TMX5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Shq1Q7TMX5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Shq1Q7TMX5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Shq1Q7TMX5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
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