Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmed3Q78IS1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms