Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rph3alQ768S4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rph3alQ768S4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms