Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ino80Q6ZPV2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ino80Q6ZPV2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ino80Q6ZPV2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms