Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slc44a1Q6X893 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc44a1Q6X893 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms