Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc82Q6PG04 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc82Q6PG04 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms