Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAJ1

Bcr, Breakpoint cluster region protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcrQ6PAJ1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BcrQ6PAJ1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BcrQ6PAJ1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms