Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8S8

B4galnt3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4galnt3Q6L8S8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
B4galnt3Q6L8S8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms