Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nop58Q6DFW4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nop58Q6DFW4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms