Protein–RNA interactions for Protein: Q641K1

Agtpbp1, Cytosolic carboxypeptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Agtpbp1Q641K1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Agtpbp1Q641K1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Agtpbp1Q641K1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms