Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim27Q62158 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
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