Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prpf4bQ61136 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf4bQ61136 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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