Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKE0

Mybpc2, Myosin-binding protein C, fast-type, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mybpc2Q5XKE0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mybpc2Q5XKE0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mybpc2Q5XKE0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Mybpc2Q5XKE0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mybpc2Q5XKE0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Mybpc2Q5XKE0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms