Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZT6

Zkscan4, MCG23028, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan4Q5SZT6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zkscan4Q5SZT6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms