Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Rtp3Q5QGU6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms