Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RilpQ5ND29 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RilpQ5ND29 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RilpQ5ND29 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RilpQ5ND29 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RilpQ5ND29 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RilpQ5ND29 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RilpQ5ND29 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RilpQ5ND29 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RilpQ5ND29 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RilpQ5ND29 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RilpQ5ND29 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RilpQ5ND29 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RilpQ5ND29 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RilpQ5ND29 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RilpQ5ND29 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RilpQ5ND29 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RilpQ5ND29 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RilpQ5ND29 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RilpQ5ND29 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RilpQ5ND29 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RilpQ5ND29 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RilpQ5ND29 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms