Protein–RNA interactions for Protein: Q5ERI8

AY761185, CRS4C-6, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY761185Q5ERI8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AY761185Q5ERI8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AY761185Q5ERI8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AY761185Q5ERI8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AY761185Q5ERI8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AY761185Q5ERI8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AY761185Q5ERI8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AY761185Q5ERI8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AY761185Q5ERI8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AY761185Q5ERI8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AY761185Q5ERI8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AY761185Q5ERI8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AY761185Q5ERI8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AY761185Q5ERI8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AY761185Q5ERI8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AY761185Q5ERI8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AY761185Q5ERI8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AY761185Q5ERI8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AY761185Q5ERI8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AY761185Q5ERI8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AY761185Q5ERI8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AY761185Q5ERI8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AY761185Q5ERI8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
AY761185Q5ERI8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AY761185Q5ERI8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AY761185Q5ERI8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AY761185Q5ERI8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AY761185Q5ERI8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AY761185Q5ERI8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AY761185Q5ERI8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AY761185Q5ERI8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AY761185Q5ERI8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms