Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam208bQ5DTT3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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