Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Foxn3Q499D0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms