Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q7

Tmprss12, Transmembrane protease serine 12, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss12Q3V0Q7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmprss12Q3V0Q7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmprss12Q3V0Q7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmprss12Q3V0Q7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmprss12Q3V0Q7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmprss12Q3V0Q7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmprss12Q3V0Q7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmprss12Q3V0Q7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmprss12Q3V0Q7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmprss12Q3V0Q7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmprss12Q3V0Q7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmprss12Q3V0Q7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmprss12Q3V0Q7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmprss12Q3V0Q7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmprss12Q3V0Q7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmprss12Q3V0Q7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmprss12Q3V0Q7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmprss12Q3V0Q7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmprss12Q3V0Q7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmprss12Q3V0Q7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmprss12Q3V0Q7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmprss12Q3V0Q7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmprss12Q3V0Q7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmprss12Q3V0Q7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmprss12Q3V0Q7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms