Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Clca4bQ3UW98 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clca4bQ3UW98 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms