Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Capn13Q3UW68 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms