Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms