Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hectd3Q3U487 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hectd3Q3U487 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hectd3Q3U487 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hectd3Q3U487 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hectd3Q3U487 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hectd3Q3U487 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hectd3Q3U487 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hectd3Q3U487 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hectd3Q3U487 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hectd3Q3U487 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hectd3Q3U487 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hectd3Q3U487 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hectd3Q3U487 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hectd3Q3U487 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hectd3Q3U487 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hectd3Q3U487 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hectd3Q3U487 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms