Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf3c3Q3TMP1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf3c3Q3TMP1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 219.2 ms