Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp39Q3TIX9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms