Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms