Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Riiad1Q3KNY5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Riiad1Q3KNY5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Riiad1Q3KNY5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms