Protein–RNA interactions for Protein: Q307W7

Kncn, Kinocilin, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KncnQ307W7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KncnQ307W7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KncnQ307W7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KncnQ307W7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KncnQ307W7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KncnQ307W7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KncnQ307W7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KncnQ307W7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KncnQ307W7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KncnQ307W7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KncnQ307W7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KncnQ307W7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KncnQ307W7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KncnQ307W7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KncnQ307W7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KncnQ307W7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KncnQ307W7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KncnQ307W7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KncnQ307W7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KncnQ307W7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KncnQ307W7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KncnQ307W7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KncnQ307W7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms