Protein–RNA interactions for Protein: Q09324

Gcnt1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt1Q09324 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gcnt1Q09324 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gcnt1Q09324 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcnt1Q09324 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcnt1Q09324 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcnt1Q09324 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcnt1Q09324 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms