Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp2Q08652 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms