Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox9Q04887 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sox9Q04887 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox9Q04887 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms