Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smarcad1Q04692 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms