Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scg2Q03517 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms