Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms