Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb4Q02738 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms