Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sec23aQ01405 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sec23aQ01405 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms