Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited1P97769 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited1P97769 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cited1P97769 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cited1P97769 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cited1P97769 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cited1P97769 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cited1P97769 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cited1P97769 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cited1P97769 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cited1P97769 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cited1P97769 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cited1P97769 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cited1P97769 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cited1P97769 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cited1P97769 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cited1P97769 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cited1P97769 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cited1P97769 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cited1P97769 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cited1P97769 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cited1P97769 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cited1P97769 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cited1P97769 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cited1P97769 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cited1P97769 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cited1P97769 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cited1P97769 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cited1P97769 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cited1P97769 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cited1P97769 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cited1P97769 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cited1P97769 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cited1P97769 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cited1P97769 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cited1P97769 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cited1P97769 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cited1P97769 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cited1P97769 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cited1P97769 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cited1P97769 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cited1P97769 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cited1P97769 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cited1P97769 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cited1P97769 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cited1P97769 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms