Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pitx2P97474 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pitx2P97474 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms