Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SgcdP82347 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SgcdP82347 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SgcdP82347 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SgcdP82347 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SgcdP82347 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SgcdP82347 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SgcdP82347 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SgcdP82347 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SgcdP82347 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SgcdP82347 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SgcdP82347 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SgcdP82347 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SgcdP82347 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SgcdP82347 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SgcdP82347 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SgcdP82347 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SgcdP82347 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SgcdP82347 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SgcdP82347 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SgcdP82347 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SgcdP82347 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SgcdP82347 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SgcdP82347 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SgcdP82347 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SgcdP82347 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SgcdP82347 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SgcdP82347 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SgcdP82347 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SgcdP82347 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SgcdP82347 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SgcdP82347 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SgcdP82347 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SgcdP82347 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.7 ms