Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gfi1P70338 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gfi1P70338 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms